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日期:2018年9月6日 10:40

GenEASYTM 全基因组敲除文库(Cat.No.GZ18009)

文库信息:
种属:Human
靶向基因:19052个
sgRNA/基因:A库3条,B库3条
靶向miRNA:1864(只限A库)
sgRNA/miRNA:4条(只限A库)
阴性对照sgRNA(无任何靶向性):1000条
载体骨架:lentiCRISPR v2(gRNA和Cas9共表达)
文库特点:
  1.本文库针对人全基因组设计
  2.文库完整性:质粒覆盖度大于99%
  3.均一性质控:丰度最高的10%的sgRNA与丰度最低的10%的sgRNA之间的丰度差异在15倍之内
  4.文库质粒以慢病毒包裹,感染效率高
  5.针对每一靶基因设计多条sgRNA
  6.文库慢病毒总量大于1×10E8TU

GenEASYTM 代谢相关基因敲除文库(Cat.No.GZ18010)

文库信息:
种属:Human
靶向基因:2981个
gRNA数量:29790条(~10条/基因)
阴性对照sgRNA(无任何靶向性):500条
载体骨架:lentiCRISPR v1(gRNA和Cas9共表达)
文库介绍:
  1.本文库针对人代谢酶、小分子转运蛋白和代谢相关转录因子设计
  2.文库完整性:质粒覆盖度大于99%
  3.均一性质控:丰度最高的10%的sgRNA与丰度最低的10%的sgRNA之间的丰度差异在15倍之内
  4.文库质粒以慢病毒包裹,感染效率高
  5.针对每一靶基因设计多条sgRNA
  6.文库慢病毒总量大于1×10E8TU

GenEASYTM 和蛋白相关基因敲除文库(Cat.No.GZ18011)

文库信息:
种属:Human
靶向基因:3733个
gRNA数量: 37330条(10条/基因)
载体骨架:pLX-sgRNA(只表达sgRNA)
文库特点:
  1.本文库针对人核蛋白基因设计。
  2.本文库为sgRNA文库,骨架载体中不含spCas9蛋白,需在稳定表达spCas9蛋白的细胞株中使用。
  3.文库完整性:质粒覆盖度大于99%
  4.均一性质控:丰度最高的10%的sgRNA与丰度最低的10%的sgRNA之间的丰度差异在15倍之内
  5.文库质粒以慢病毒包裹,感染效率高
  6.针对每一靶基因设计多条sgRNA
  7.文库慢病毒总量大于1×10E8TU

文库应用

CRISPR基因敲除文库是发现关键基因和信号通路,深入理解人类重大疾病致病机理,开发预防和治疗方案的利器。总结来说,可以有以下用处:
  1.对于疗效显著但机制不明的药物,可进行作用靶点的筛选
  2.挖掘肿瘤治疗的潜在靶标,为药物研发提供帮助
  3.鉴于抗肿瘤药物的耐药性,探寻相关耐药基因
  4.寻找合成致死基因,以提供联合用药治疗方案

参考文献

  1、Li S, Li M, Liu X, et al. Genetic and Chemical Screenings Identify HDAC3 as a Key Regulator in Hepatic Differentiation of Human Pluripotent Stem Cells[J]. Stem Cell Reports, 2018, 11(1):22-31.
  2、Shalem O, Zhang F. Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells.[J]. Science, 2014, 343(6166):84.
  3、Tzelepis K, Koike-Yusa H, Debraekeleer E, et al. A CRISPR Dropout Screen Identifies Genetic Vulnerabilities and Therapeutic Targets in Acute Myeloid Leukemia[J]. Cell Reports, 2016, 17(4):1193-1205.
  4、Wang T, Lander E S. Genetic screens in human cells using the CRISPR-Cas9 system.[J]. Science, 2014, 343(6166):80-84.
  5、Kalikoff B. An Essential Role of the Mitochondrial Electron Transport Chain in Cell Proliferation Is to Enable Aspartate Synthesis[J]. Cell, 2015, 162(3):540-551.

所属类别: 载体/文库构建

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